Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NOP14-205ENST00000507120 703 ntTSL 318.55■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HMGN1-220ENST00000492280 2707 ntTSL 513.83□□□□□ -0.24e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 220.85■□□□□ 0.932e-12■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 ACADVL-235ENST00000583848 503 ntTSL 315.4■□□□□ 0.062e-12■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 PPP2CB-209ENST00000523023 448 ntTSL 37.53□□□□□ -1.24e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.649e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DSTN-202ENST00000449141 795 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.882e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.914e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.374e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GLRX3-203ENST00000481034 1921 ntTSL 1 (best)23.62■■□□□ 1.374e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.324e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.064e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 14e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.794e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.744e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.494e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.474e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 316.62■□□□□ 0.254e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 316.57■□□□□ 0.244e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-204ENST00000535501 921 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.164e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 315.86■□□□□ 0.134e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RNF181-206ENST00000461845 623 ntTSL 215.27■□□□□ 0.044e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-212ENST00000544341 945 ntTSL 314.96□□□□□ -0.014e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.064e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LINC00694-202ENST00000634610 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MICA-208ENST00000421350 1005 ntTSL 513.77□□□□□ -0.214e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GLRX3-205ENST00000496195 317 ntTSL 213.47□□□□□ -0.254e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 513.35□□□□□ -0.271e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.424e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RNF181-202ENST00000414390 327 ntTSL 212.39□□□□□ -0.434e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LINC00694-203ENST00000636468 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-17■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LINC00694-201ENST00000416124 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.544e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-209ENST00000540536 883 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MPHOSPH9-215ENST00000544217 484 ntTSL 39.66□□□□□ -0.864e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-205ENST00000536197 879 ntTSL 29.21□□□□□ -0.944e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.944e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-207ENST00000538761 886 ntTSL 39.02□□□□□ -0.974e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.274e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 WASHC3-211ENST00000542923 477 ntTSL 36.96□□□□□ -1.34e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MPHOSPH9-213ENST00000541603 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.374e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-212ENST00000506885 750 ntTSL 36.3□□□□□ -1.44e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-228ENST00000513873 538 ntTSL 35.71□□□□□ -1.54e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.514e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.534e-9■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPS2-214ENST00000533186 625 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-50■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PPP1CC-203ENST00000546904 1133 ntTSL 25.52□□□□□ -1.537e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PPP1CC-205ENST00000550261 747 ntTSL 55.36□□□□□ -1.557e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 221.67■■□□□ 1.065e-15■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.875e-15■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.685e-15■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 TMEM214-208ENST00000460665 1967 ntTSL 216■□□□□ 0.155e-15■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.292e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ATP5G2-206ENST00000550241 406 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-11■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MRPL18-204ENST00000480842 1075 ntTSL 316.15■□□□□ 0.186e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.136e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 MRPL18-202ENST00000476826 758 ntTSL 314.83□□□□□ -0.046e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 217.11■□□□□ 0.334e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DDX47-202ENST00000358007 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DDX47-212ENST00000545038 2357 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.054e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DDX47-207ENST00000542123 2689 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.684e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.19e-70■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.949e-70■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.049e-70■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.449e-70■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PRDX2-205ENST00000478908 413 ntTSL 212.94□□□□□ -0.345e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PRDX2-206ENST00000498785 505 ntTSL 212.35□□□□□ -0.435e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CYB5B-206ENST00000568237 577 ntTSL 56.23□□□□□ -1.411e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ANKRD13B-203ENST00000488766 2671 ntTSL 519.88■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ANKRD13B-204ENST00000493506 2465 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ANKRD13B-202ENST00000487527 3023 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.326e-7■□□□□ 10.6
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