Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTGDRQ13258 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDRQ13258 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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