Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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