Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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IFT88Q13099 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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