Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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