Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC20Q12834 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms