Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TROQ12816 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TROQ12816 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TROQ12816 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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