Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXO1Q12778 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXO1Q12778 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXO1Q12778 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXO1Q12778 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXO1Q12778 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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