Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms