Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms