Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TYRO3Q06418 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms