Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms