Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms