Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A2Q01362 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms