Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms