Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL3P58215 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms