Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP12AP54707 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms