Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms