Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms