Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA4P12838 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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DEFA4P12838 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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