Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNP07948 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNP07948 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNP07948 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYNP07948 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYNP07948 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNP07948 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNP07948 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNP07948 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms