Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT34O76011 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT34O76011 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 675.7 ms