Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALUO43852 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALUO43852 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms