Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO3O43524 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms