Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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NDUFS4O43181 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms