Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TSPAN4O14817 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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