Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC9O14530 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms