Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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