Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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