Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms