Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms