Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms