Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN11AQ9UI33 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms