Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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