Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms