Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms