Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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