Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms