Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms