Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms