Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms