Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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