Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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