Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms