Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms