Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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