Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRABD2AQ86V40 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms