Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms