Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms