Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms